Le 20 avril eut lieu la première rencontre maritime. Trois navires Gênois, armés par le pape, rencontrant en reoute un bâtiment grec transportant de matériel de guerre, du blé et du vin, l’escortèrent et vinrent aux approches de la cité. La rencontre entre les forces ennemies eut lieu au large de Yenikapı. Le sultan avait ordonné d’empêcher coute que coute la pénétration en Corne d’Or de ces navires. La volonté du Sultan ne put se réaliser, car, malgré l’abordage des navires turcs et leurs tentatives de sabordage à coups de hache, les navires gênois purent s’échapper, et, profitant du violent vent en leur faveur, pénétrer dans les eaux de la Corne d’Or. Mehmet II destitua de ses fonctions le commandant de la flotte. Le borbardement intensif contre les murailles donnant sur les terres et ayant duré toute une semaine avait sérieusement endommagé les fortifications.
L’empereur de Byzance voulut à nouveau engager des pourparlers de paix. Le Grand Vizir, était, par ailleurs, favorable à la cessation des hostilités. Dans le Conseil de la guerre, il fit connaitre son avis. Mais des savants tels que Molla Gûrani et Akşemsettin et des commandants tels que Zaganos Paşa étaient d’avis de continuer l’attaque et de pousser plus avant les hostilités. Tel était d’ailleurs le désir du jeune monarque.
En cette phase des opérations le Sultan, devant le sérieux barrage que consistait la chaîne barrant l’entreée de la Corne d’Or, émit l’idée que l’on pourrait hisser les navires sur les rives de Tophane, et, en les larguant par les coteaux, les faire descendre à la mer, en pleine Corne d’Or. Le conseil ayant adopté ce projet, soixante sept navires de guerre furent hissés à terre, et, à l’aide de glissoires huillées faciliant leur transport, tirés par hommes et bœufs jusqu’aux eaux de la Corne d’Or. Le vent, gonflant les voiles, facilitait cette extraordinaire opération. A l’aube du 21 avril, les canons installés sur les hauteurs de Galata commencèrent le bombardement de la flotte byzantine ancrée en Corne d’Or afin de protéger les navires turcs et en faciliter l’immersion.
La colonie Gênoise de Galata avait jugé plus profitable de ne pas avertir Byzance des opérations qui se préparaient tout près de leur cité. Les navires de guerre turcs, flottant désormais dans les eaux de la Corne d’Or, terrifièrent les byzantins. le bombardement intensif des murailles barrant la ville tout au long des rivages obligea les byzantins à y masser une partie de leurs forces. De continuelles mésententes surgissaient entre les Vénitiens et les Gênois, mercenaires à la solde de Byzance et les commandants byzantins. Les alliés, qui se trouvaient d’accord pour l’anéantissement de l’escadre ottomane de la Corne d’Or, en changèrent le Vénitien Giaccomo Cocco. Mais ce dernier et ses cent cinquante marins furent mis hors combat devant le feu nourri des navires turcs. Une quantaine de marins ennemis qui réussirent à aborder la rive furent exterminés par les soldats turcs avant d’avoir pu se réfugier de l’autre côté des murailles. L’empereur de Byzance fit pendre à son tour, sur les créneaux, deux cent soixante des soldats ottomans qu’ils avait fait prisonniers.
Abordés côte à côte, les navires ottomans avaient jetés un pont sur la Corne d’Or, faisant passer à la rive d’un face d’importants contingents. Plein d’appréhension, l’empereur de bzyance ordonna à un de ses navires de prendre en secret le large pour demander secours à ses frères en Morée. Mais ce navire se perdit et on n’entendit plus parler. La résistance et le moral de foule byzantine était à bout.
De nouvelles attaques générales furent engagées contre la cité; la nuit du 6 et 7 Mai et au cours de la matinée du 12. L’escadre turque de la Corne d’Or participait au feu tandis que d’autres navires tentaient de franchir la chaîne qui barrait l’entrée du port. Ces opérations avaient tout particulièrement pour but d’affaiblir les forces byzantines du côté de la terre en les obligeant de se masser aux rivages.

Le 18 Mai les ottomans approchèrent des murs de Topkapı une tour roulante en bois, plus haute que ceux-ci. Les soldats juchés sur cette tour s’attaquèrent de très près aux créneaux pendant qu’en bas les assaillants travaillaient à combler les fossés. La nuit venue, d’importantes brèches avaient été faites dans les murailles; la cité se trouvait ouverte à l’invasion. L’empereur, profitant de l’obscurité avait massé une foule d’hommes, de femmes et d’enfants qui, du haut des murailles, réussit à incendier la tour.
Mais dès le lendemain le bombardement recommença. L’artillerie, qui sans cesse lançait des boulets lourds de 600 kilos, labourait la terre de l’autre côté des murs et achevait de démoraliser les byzantins. ainsi passèrent les matinées et les soirées des 20, 21, 22 mai. Un navire, qui était parti pour demander du secours, revint les mains vides le 20 Mai. Le désespoir augmenta  parmi les défenseurs et la population de la ville.Le même jour, le Sultan chargea un ambassadeur de réclamer la capitulation pacifique de la cité. Les citoyens byzantins désireux de partir pouvaient le faire en emportant leurs biens et leur trésor, et l’on ne toucherait pas aux demeures de ceux qui voulaient rester. Le sultan prommettait à l’empereur l’archvêché de Morée.
D’accord avec son conseil, l’empereur fit répondre qu’il ne pouvait remettre sa ville aux mains de l’ennemi et qu’il préférait de mourir l’arme en main. Par contre, il était prêt à verser les impôts les plus lourds au cas où le siège erait levé. D’après certaines sources, les génois de Galata avaient influé la terreur de cette réponse de l’empereur de Byzance. Le 26 mai, un ambassadeur du nouveau roi de Pologne, Vladislav, vint à nouveau devant Mehmet II pour le prier de mettre fin aux hostilités.
Mehmet II réunit une fois encore le Conseil de Guerre. Le Grand Vizir formula à nouveau son opinion en faveur de la paix. D’après lui, au cas où la ville serait prise par les Turcs, l’Occident se mettrait en branle et présentait de grands dangers. Cependant le Sultan et Zaganos Paşa, connaissant les dissentions qui divisaient les pays européens, décidèrent de continuer la lutte. Les évènements, par la suite, devaient leur donner raison.
Dans un long discours adressé au Conseil, le Sultan l’informa de la situation stratégique à Istanbul et dans les pays européens et donna ses derniers ordres. Il demanda aux commandants de fournir à leurs contingents les informations qu’il venait de leur donner et d’organiser un repos général des forces avant l’attaque finale et décisive. Chaque chef militaire devait s’élever en grade selon les victoires qu’il remporterait. Par ailleurs, les premiers qui franchiraient les murailles recevraient des terres et se verraient attribuer certaines hautes fonctions.
Le 28 Mai un étrange silence régnait au quartier générales der forces ottomanes. La nuit, l’armée ottomane ayant allumé des milliers de torches, la ville se trouvait entourée par terre et par mer d’un immense cercle de feu. La nuit du 28 au 29 Mai, à l’aube, les forces occupèrent leurs points stratégiques. Aux sons de milliers de tambours et de cymbales le grand assaut commença. Le point où se déroulaient principalement les attaques était la vallée de la source de Bayrampaşa, au nord de Topkapı, l’actuelle porte de la ville. Au cours des trois successives attaques sanglates qui eurent lieu dans cette partie, cinquante mille hommes de part et d’autre s’entretuèrent. Par vagues ininterompues les assaillants montaient aux échelles appuyées sur les murs, mouraient et étaient remplacés par des nouvelles vagues. Les cloches de la ville sonnaient, les habitants transportaient vers les fortifications des pierres et du matériel de guerre.
Guistiniani, le commandant Gênois fut blessé au plus fort de la mêlée. L’empereur et les hauts fonctionnaires de son état guerroyaient devant les murailles de Topkapı, le point le plus sensible de la défense byzantine. Blessé, Guistiniani demanda à l’empereur de se retirer à son vaisseau. La réponse de Guistiniani est historique: <<En empruntant la route que Dieu ouvre aux Turcs!>>.
Le vide laissé par le départ du commandant gênois active les attaques des ottomans. Un vigoureux soldat du nom d’Ulubatlı Hasan, suivi de trois de ses camarades monta sur l’une des murailles et y planta le drapeau ottomans.